Plasma-SeqSensei™ (PSS) tahlilleri, yeni nesil dizileme teknolojisini kullanarak meme kanserli hastaların kan plazmasından dolaşan tümör DNA'sındaki (ctDNA) mutasyonların son derece hassas ve kantitatif tespitini sağlar. PSS'nin kısa ve standartlaştırılmış iş akışı, dizüstü bilgisayar uyumlu Plasma-SeqSensei™ IVD Yazılımı kullanılarak okunması kolay raporların oluşturulması da dahil olmak üzere iki gün içinde sonuç verir.

Kit, yerleşik ve ortaya çıkan öngörücü belirteçleri, direnç mutasyonlarını ve kanserde sıklıkla meydana gelen genetik değişiklikleri tespit etmek için BRAF, EGFR, KRAS, NRAS ve PIK3CA gibi anahtar gen mutasyonlarını kapsar.

PSS Solid Kanser IVD Kiti, klinisyenleri aşağıdaki konularda desteklemeyi amaçlamaktadır:

minimal kalıntı hastalığı (MRD) tespit etmek
rekürrens gözetimi
(neo-)adjuvan yanıt izleme, monitörizasyon
kolorektal kanser hastaları için anti-epidermal büyüme faktörü reseptörü (EGFR) tedavisinin potansiyel faydasını belirlemek için RAS mutasyon durumunun analizi

Daha fazlasını keşfet

PSS teknolojisi

Kendinden emin mutant raporlama

Hassasiyeti artırmak ve dizilemeyle ilişkili hata oranlarını azaltmak için PSS kitaplığı hazırlama iş akışı SafeSEQ teknolojisini1 kullanır. Bu teknoloji, hedef seçim adımı sırasında her DNA molekülüne benzersiz bir tanımlayıcı (UID) atar. UID'ler, numunelerdeki gerçek mutasyonları izlemeye ve tanımlamaya yardımcı olur ve bunları polimeraz veya dizileme hatalarından ayırt eder. PSS, 10.000 yabanıl tip kopyanın arka planında %95 kesinlik ile %0.07 ve daha yüksek mutant alel fraksiyonlarını (MAF) tespit eder.

MAF'ın Ötesinde - Mutlak Mutant Kantifikasyonu

PSS teknolojisi, altı mutant molekülün tespit sınırına (LOD) kadar geniş bir dinamik aralıkta tümöre özgü dizilerin sağlam bir şekilde ölçülmesine izin veren bir dahili niceleyici Quantispike kullanır. Ek olarak, test edilen kan hacminde tespit edilen bir dizi mutant molekül olarak bildirilen mutlak kantifikasyon, zaman içinde ctDNA seviyelerindeki değişikliklerin anlamlı bir karşılaştırmasını kolaylaştırmaya yardımcı olur.

Plasma-SeqSensei™ IVD Software

PSS IVD Yazılımı, dizileme çalışmalarını zahmetsizce planlama ve analiz etme ve verileri kolayca raporlama imkanı sunar. Bir ofis veya dizüstü bilgisayarında çalışmak üzere tasarlanmış ilk IVD sertifikalı yazılımdır - iş istasyonu veya sunucu yapısı gerekmez. Arayüz üç işlevsel modüle ayrılmıştır: çalışma planlama, veri analizi ve raporlama. Otomatik olarak oluşturulan raporlar, her ikisi de MAF'leri listeleyen numune ölçümlerini ve mutasyon durumunu ve ayrıca numune hacminde tespit edilen mutlak mutant molekül sayısını ve dizileme kalite ölçümlerini içerir.

Referans

Kinde, I., Wu, J., Papadopoulos, N., Kinzler, K. W., & Vogelstein, B. (2011). Detection and quantification of rare mutations with massively parallel sequencing. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 108(23), 9530–9535. https://doi.org/10.1073/pnas.1105422108

Teknik Özellik

Özellik	Plasma-SeqSensei^TM Solid Kanser IVD Kit
Örnek tipi	Tam kan ve plazma
Örnek kapasitesi	Kit başına 2 – 16 örnek
QC fonksiyonu	Pozitif kontrol ve templatesiz kontrol (NTC) her çalışmada uygulanır
Uyumlu platformlar	Illumina NextSeq 500/550™
Gerekli DNA miktarı	5.7–95 ng/116 µl
Amplikon sayısı	17
Sensitivite	10.000 yabanıl tip kopyada %95 kesinlikte %0.07 alel frekansı
Cut-off	7 mutant molekül
Cat. No.	ZR150534

Gen hedefleri

Gen	Transcript*	Kodlayan bölge başlangıç	Kodlayan bölge bitiş	En sık saptanan mutasyonlar
BRAF	ENST00000288602	1,383	1,431	G469A/R/V/E, G466V/E
BRAF	ENST00000288602	1,742	1,813	V600E/K/R/M, K601E, D594G
EGFR	ENST00000275493	2,116	2,177	G719A/S
EGFR	ENST00000275493	2,565	2,620	L858R, L861Q
EGFR	ENST00000275493	2,225	2,279	E746_A750del, L747_P753delinsS, L747_T751del, L747_A750delinsP, E746_S752delinsV
EGFR	ENST00000275493	2,361	2,403	T790M
EGFR	ENST00000275493	2,284	2,325	S7681I
KRAS	ENST00000256078	419	445	A146T/V
KRAS	ENST00000256078	326	352	K117N
KRAS	ENST00000256078	34	102	G12D/V/C/A/S/R/F, G13D/C/R/V/A
KRAS	ENST00000256078	169	102	Q61H/R/L/H/K, A59T
NRAS	ENST00000369535	162	210	Q61R/K/L/H
NRAS	ENST00000369535	420	449	A146V/T
NRAS	ENST00000369535	1	52	G12D/C/S/A/V/R, G13R/V/C/S
NRAS	ENST00000369535	341	364	L120D, K117R
PIK3CA	ENST00000263967	3,118	3,195	H1047R/L/Y, G1049R, M1043I/V
PIK3CA	ENST00000263967	1,611	1,659	E545K/A/G/Q, E542K, Q546K/R/P